Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Col5a1O88207 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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