Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20795J3QP49 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Gm20795J3QP49 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm20795J3QP49 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm20795J3QP49 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm20795J3QP49 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm20795J3QP49 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm20795J3QP49 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm20795J3QP49 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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