Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms