Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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RNF7Q9UBF6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF7Q9UBF6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF7Q9UBF6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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