Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ybx3Q9JKB3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms