Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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Usp29Q9ES63 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp29Q9ES63 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp29Q9ES63 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp29Q9ES63 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp29Q9ES63 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Usp29Q9ES63 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp29Q9ES63 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp29Q9ES63 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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