Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pkp2Q9CQ73 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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