Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nudcd2Q9CQ48 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms