Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmed9Q99KF1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms