Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms