Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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