Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnna3Q65CL1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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