Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PtprdQ64487 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PtprdQ64487 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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