Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nell2Q61220 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nell2Q61220 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nell2Q61220 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nell2Q61220 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms