Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms