Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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