Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps8Q0P5W1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vps8Q0P5W1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms