Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbp2Q08652 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms