Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gabpb1Q00420 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms