Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ctdsp1P58466 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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