Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
GdnfP48540 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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GdnfP48540 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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GdnfP48540 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
GdnfP48540 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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