Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gjb1P28230 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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