Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Srp54P14576 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms