Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTNSO60931 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTNSO60931 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms