Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Dnajb6O54946 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajb6O54946 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms