Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Opn1mwO35599 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Opn1mwO35599 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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