Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cnih1O35372 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Cnih1O35372 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih1O35372 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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