Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kpna4O35343 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kpna4O35343 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms