Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm20828J3KMI7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms