Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Clstn2Q9ER65 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clstn2Q9ER65 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms