Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Smg9Q9DB90 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Smg9Q9DB90 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smg9Q9DB90 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Smg9Q9DB90 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Smg9Q9DB90 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smg9Q9DB90 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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