Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Syf2Q9D198 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms