Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc47Q9D024 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc47Q9D024 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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