Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms