Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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