Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r200Q8R281 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms