Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Hpf1Q8CFE2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hpf1Q8CFE2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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