Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Snx8Q8CFD4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Snx8Q8CFD4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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