Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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