Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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