Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc50Q810U5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms