Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Foxd1Q61345 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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