Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms