Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp39Q3TIX9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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