Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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