Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms