Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg6P61406 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg6P61406 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg6P61406 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms