Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgd1P52734 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgd1P52734 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms