Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lig1P37913 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lig1P37913 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lig1P37913 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lig1P37913 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms