Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc1P34928 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms